Es definida como un grupo de enfermedades que afectan el aparato gastrointestinl, principalmente el intestino. Básicamente se refiere a la enfermedad de Crohn y la colitis ulcerosa. La causa exacta de estas enfermedades no son del todo conocidas, sin embargo existe una hipótesis de que el sistema inmune genera esta alteración, ya sea por cuestiones relacionadas o la genética con factores adjuntos como son la mala alimentación, fármacos, el tabaco y el estrés, entre otros, causando una reacción inflamatoria que lesiona el tejido y daña los microorganismos benéficos (microbiota intestinal), existentes en el intestino.
La enfermedad de Crohn afecta con mayor frecuencia la porción íleon terminal, que quiere decir la última parte del intestino delgado, aunque puede afectar todo el conducto. Los síntomas más comunes son diarrea crónica, en algunos casos estreñimientos, dolor abdominal que aminora o se detiene con la defecación, entre otras.